Existem na Câmara as comissões permanentes e as temporárias. Também conhecidas como comissões temáticas, as permanentes são 25, nomeadas pelo assunto de que tratam. Além de apreciar e dar parecer sobre os projetos a elas distribuídos, também acompanham os planos e programas governamentais e a fiscalização orçamentária da União e realizam audiências públicas para debater propostas ou ouvir autoridades.

Ao longo do ano legislativo, cada deputado pode participar como titular de apenas uma comissão permanente, com exceção das consideradas cumulativas, como a Comissão de Meio Ambiente e Desenvolvimento Sustentável e a de Legislação Participativa. Já as temporárias são criadas para debater projetos específicos, Medidas Provisórias ou fazer investigações. São divididas entre especiais, de inquérito e externas.